همراهی Streptomyces caniscabiei و S. bobili با بیماری جرب معمولی سیب زمینی در استان کرمان

پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1800-25IPPC (R1)
نویسندگان
1سازمان تات، مرکز تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی استان یزد، ایران
2گروه بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
3مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمان
4پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، پژوهشگاه افضلی پور، دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
بیماری جرب معمولی، به طور معنی داری کیفیت و بازار پسندی محصول سیب زمینی را کاهش می دهد. در دنیا گونه های مختلفی از جنس Streptomyces به عنوان عامل بیماری جرب سیب زمینی گزارش شده اند. طی سال های 1400 تا 1403 از مزارع سیب زمینی استان کرمان بازدید به عمل آمد و از غده های سیب زمینی با علائم جرب نمونه برداری شد. سپس از بافت های علایم دار عصاره تهیه و بر روی محیط آب-آگار کشت داده شد. پس از نگهداری ظروف پتری مایه زنی شده در دمای 28 درجه سانتی گراد، از پرگنه های روییده مشابه جنس Streptomyces ، دی ان آ استخراج شد. بعد از آن، نمونه های دی ان آ از نظر وجود ژنهای بیماریزایی و با آغازگرهای اختصاصی در واکنشهای زنجیره ای پلیمراز، ارزیابی شدند. همچنین با استفاده از آغازگرهای اختصاصی شناسایی گونه های بیماریزای گیاهی این جنس، واکنشهای زنجیره ای پلیمراز اختصاصی انجام شد. پس از آن، باتوجه به اهمیت جایگاه ژن trpB در شناسایی گونه های جنس یاد شده که در مطالعات اخیر بر آن تاکید شده است، این ژن از استرین های جداسازی شده، با آغازگر های اختصاصی تکثیر و تعیین ترادف شد. نتایج نشان داد که این استرین ها دارای ژنهای بیماریزایی از نوع txtAB، txtA و tomA هستند و در هیچ یک از آنها در پی سی آر های اختصاصی شناسایی گونه های بیماریزای گیاهی، نوار دی ان ای تکثیر نشد. اما تجزیه و تحلیل ژنتیکی ترادف ژنtrpB نشان داد که چهار استرین بیشترین شباهت را باگونه S. caniscabiei و یک استرین بیشترین شباهت را با گونه S. bobili دارند. گونه اول ابتدا از کشورهای آمریکا، مصر و چین، ولی گونه دوم فقط از کشور چین گزارش شده است. با توجه به این که استان کرمان از استانهای پیشرو تولید سیب زمینی در کشور است و از طرفی شیوع گسترده این بیماری در منطقه، شناسایی گونه های همراه با آن و مدیریت این بیماری لازم است.
کلیدواژه ها
 
Title
Association of Streptomyces caniscabiei and S. bobili with potato common scab disease in Kerman province, Iran
Authors
mo,jtaba rezaee ahmadabady, Akbar Hosseinipour Hosseinipour, mehdi azadvar, azadeh lohrasbi
Abstract
Potato common scab disease (PCSD) considerably reduces the quality and marketability of potatoes. Different Streptomyces species were reported as causal agents of the PCSD worldwide. This study aimed to identify Streptomyces species associated with the disease in Kerman province. To achieve this, potato fields in the province were surveyed from 2022 to 2024, and potato tubers showing scab symptoms were sampled. Then, extracts were prepared from the symptomatic tissues and cultured on a water-agar medium on Petri plates. After the inoculated Petri dishes were incubated at 28 °C, DNA was extracted from the grown colonies resembling the Streptomyces genus. Subsequently, the DNA samples were evaluated for the presence of pathogenicity genes using specific primers in polymerase chain reactions (PCRs). Moreover, specific PCRs were performed using reported primers to identify plant pathogenic species belonging to the genus. Then, considering the trpB gene's importance in identifying the genus species, as emphasized in recent studies, the gene was amplified from isolated strains and sequenced. As a result, the pathogenicity genes of txtAB, txtA, and tomA types were detected in all strains; however, the DNA bands were amplified in none using reported-specific primers for plant pathogenic Streptomyces species. Phylogenetic analysis of the trpB gene sequences identified four strains closely related to S. caniscabiei species, while one strain corresponds to S. bobili species. The former was first reported in the USA, Egypt, and China, whereas the latter was from China. Considering that Kerman province is one of the leading provinces of potato production in Iran, and on the other hand, due to the widespread common scab in the region, it is necessary to identify the species associated with the disease and its control management.
Keywords
Streptomyces, Pathogenicity gene, Potato scab, trpB gene, Kerman province