بررسی تنوع ژنتیکی ارقام پیازبا استفاده از نشانگرهای مولکولی در ارتباط با مقاومت به پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق
پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1232-25IPPC
نویسندگان
1ندارد
2هییت علمی دانشگاه ازاد اسلامی اصفهان خوراسگان
3مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منایع طبیعی استان اصفهان
4مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی اصفهان
5مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان
چکیده
در این تحقیق،با استفاده از نشانگرهای RAPD ،ISSR وSRAP ارزیابی تنوع ژنتیکی هجده ژنوتیپ مختلف پیازبا سطوح مختلف مقاومت به
بیماری پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق Fusarium oxysporum f.sp. cepae مورد تجزیه و تحلیل قرارداده شد. نتایج به دست آمده نشان داد که
میانگین چندشکلی بین آغازگرهای RAPD از 56 تا 82 درصد ،ISSR از 61 تا 82 درصد وSRAP از 56 تا 76 درصدمتغیربود. در مجموع، با
ارزیابی شاخص های MI ، PIC ، I وH دربین پرایمرهای ISSR ،آغازگرهایISSR1 وISSR10 .پرایمرهایSRAP ، پرایمرهای SRAP1
و SRAP6 و ازبین آغازگرهای RAPD، آغازگرهای RAPD3 و RAPD4 بهترین عملکرد را در بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های هدف از خود
نشان دادند.همچنین در بین دندروگرام های تولیدشده بر اساس ماتریس های شباهت ،همبستگی معنی داری وجودداشت. همچنین الگوی طبقه بندی در
دندروگرام ها،همبستگی نسبی را با گروه بندی شدت بیماری نشان داد. به طوریکه در هر سه نشانگر مورد مطالعه، ژنوتیپ های صبا و صبا
-HSازمقاومترین ژنوتیپ هابه بیماری بیماری پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق دریک شاخه قرار گرفتند و ژنوتیپهای چشم طلایی وسحر–HS
حساسترین ژنوتیپ هابه این بیماری نیزبه طور جداگانه در شاخه دیگری قرار گرفتند.البته، در تایید این موضوع،ژن ها و آنزیم های دفاعی
نیز بررسی شدند که در ارقام مقاوم مربوطه نسبت به اقام حساس پیاز به طوری معناداری افزایش یافتند. این یافته ها ژنوتیپ های جدید
مقاوم پیازبه این بیماری را معرفی میکند و همچنین،میتوانند برای انتخاب پیازهای مقاوم به بیماری در برنامه های اصلاحی برای کاهش
شدت آلودگی برای بیماری پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق استفاده شوند.
بیماری پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق Fusarium oxysporum f.sp. cepae مورد تجزیه و تحلیل قرارداده شد. نتایج به دست آمده نشان داد که
میانگین چندشکلی بین آغازگرهای RAPD از 56 تا 82 درصد ،ISSR از 61 تا 82 درصد وSRAP از 56 تا 76 درصدمتغیربود. در مجموع، با
ارزیابی شاخص های MI ، PIC ، I وH دربین پرایمرهای ISSR ،آغازگرهایISSR1 وISSR10 .پرایمرهایSRAP ، پرایمرهای SRAP1
و SRAP6 و ازبین آغازگرهای RAPD، آغازگرهای RAPD3 و RAPD4 بهترین عملکرد را در بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های هدف از خود
نشان دادند.همچنین در بین دندروگرام های تولیدشده بر اساس ماتریس های شباهت ،همبستگی معنی داری وجودداشت. همچنین الگوی طبقه بندی در
دندروگرام ها،همبستگی نسبی را با گروه بندی شدت بیماری نشان داد. به طوریکه در هر سه نشانگر مورد مطالعه، ژنوتیپ های صبا و صبا
-HSازمقاومترین ژنوتیپ هابه بیماری بیماری پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق دریک شاخه قرار گرفتند و ژنوتیپهای چشم طلایی وسحر–HS
حساسترین ژنوتیپ هابه این بیماری نیزبه طور جداگانه در شاخه دیگری قرار گرفتند.البته، در تایید این موضوع،ژن ها و آنزیم های دفاعی
نیز بررسی شدند که در ارقام مقاوم مربوطه نسبت به اقام حساس پیاز به طوری معناداری افزایش یافتند. این یافته ها ژنوتیپ های جدید
مقاوم پیازبه این بیماری را معرفی میکند و همچنین،میتوانند برای انتخاب پیازهای مقاوم به بیماری در برنامه های اصلاحی برای کاهش
شدت آلودگی برای بیماری پوسیدگی فوزاریومی ریشه و طبق استفاده شوند.
کلیدواژه ها
Title
Investigating the genetic diversity of onion cultivars using molecular markers associated with
resistance to Fusarium root and basal rot
Authors
SAEIDREZA POURSAKHI, HOSEINALI ASADI, Mehdi Nasr Esfahani, zahra abbasi, hamed hassanzade khankahdani
Abstract
In this research, RAPD, ISSR and SRAP markers were used to evaluate the genetic diversity of eighteen
different onion genotypes with different levels of resistance to Fusarium root and basal rot disease,
Fusarium oxysporum f.sp. cepae. The results showed that the average polymorphism between RAPD
primers varied from 56 to 82%, ISSR from 61 to 82%, and SRAP from 56 to 76%. Overall, by evaluating
MI, PIC, I and H indices among ISSR primers, ISSR1 and ISSR10 primers. SRAP primers, SRAP1 and
SRAP6 primers and among RAPD primers, RAPD3 and RAPD4 primers showed the best performance
in examining the genetic diversity of the target onion populations. There was a significant correlation
between the dendrograms produced based on the similarity matrices. The classification pattern in the
dendrograms showed a relative correlation with the disease severity grouping. So that in all the three
markers studied, Saba and Saba-HS genotypes are among the most resistant genotypes to Fusarium root
and basal rot disease and located to one branch, and Golden Eye and Sahar-HS genotypes are the most
susceptible genotypes to this disease in another branch separately. Of course, in confirmation of this
issue, defense related marker genes and enzymes were also investigated, which were significantly
increased in the corresponding resistant cultivars compared to the susceptible onion cultivars. These
findings introduce new onion genotypes resistant to this disease and also they can be used to select
disease-resistant onions in breeding programs to reduce the severity of the onion Fusarium root and rot
basal rot disease.
different onion genotypes with different levels of resistance to Fusarium root and basal rot disease,
Fusarium oxysporum f.sp. cepae. The results showed that the average polymorphism between RAPD
primers varied from 56 to 82%, ISSR from 61 to 82%, and SRAP from 56 to 76%. Overall, by evaluating
MI, PIC, I and H indices among ISSR primers, ISSR1 and ISSR10 primers. SRAP primers, SRAP1 and
SRAP6 primers and among RAPD primers, RAPD3 and RAPD4 primers showed the best performance
in examining the genetic diversity of the target onion populations. There was a significant correlation
between the dendrograms produced based on the similarity matrices. The classification pattern in the
dendrograms showed a relative correlation with the disease severity grouping. So that in all the three
markers studied, Saba and Saba-HS genotypes are among the most resistant genotypes to Fusarium root
and basal rot disease and located to one branch, and Golden Eye and Sahar-HS genotypes are the most
susceptible genotypes to this disease in another branch separately. Of course, in confirmation of this
issue, defense related marker genes and enzymes were also investigated, which were significantly
increased in the corresponding resistant cultivars compared to the susceptible onion cultivars. These
findings introduce new onion genotypes resistant to this disease and also they can be used to select
disease-resistant onions in breeding programs to reduce the severity of the onion Fusarium root and rot
basal rot disease.
Keywords
Gene, ISSR, RAPD, Primer, SRAP