اولین گزارش از وقوع ویـروس چروکیـدگی قهـوه‌ای میوه گوجه‌فرنگی در گلخانه‌های گوجه‌فرنگی استان یزد
پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1339-25IPPC
نویسندگان
رضا فرجیانی 1 ، حسین معصومی1 ، سید علیرضا اسمعیل زاده حسینی2 ، جهانگیر حیدرنژاد3 ، اکبر حسینی پور1 ، محمد مداحیان1
1گروه بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
2بخش تحقیقات گیاه پزشکی مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان یزد، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، یزد، ایران
3عضو هیئت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
ویـروس چروکیـدگی قهـوه‌ای میوه گوجه‌فرنگی (Tomato brown rugose fruit virus, ToBRFV)، یک بیمارگر مهم گیاه گوجه‌فرنگی از جنس Tobamovirus و خانواده Virgaviridae می‌باشد. به‌منظور ردیابی ToBRFVدر گلخانه‌های گوجه‌فرنگی شهرستان یزد طی سال 1402 از بوته‌های گوجه‌فرنگی دارای علائم موزاییک، تاولی، بدشکلی برگ و نقش حلقوی و لکه کلروتیک روی میوه نمونه‌بـرداری انجام شد. آر‌ان‌ای کـل از بافـت برگ‌ها و میوه‌های جمع‌آوری شده با استفاده از کیت شرکت پارس طوس استخراج و در واکنش زنجیره‌ای پلـی‌مـراز رونویسـی معکـوس (RT-PCR) مورد استفاده قرار گرفتند. بر‌اساس نتایج بدست آمده، از 88 نمونه گیاه علائم دار گوجه فرنگی بررسی شده در آزمون RT-PCR، در 43 مورد باند 800 جفت‌بازی مربوط بـه ژن پروتئین پوششی ToBRFV تکثیر و آلودگی در آن نمونه‌ها ردیابی گردید. از نمونه های آلوده هفت جدایه بر‌اساس رقم و مناطق نمونه‌برداری، جهت مطالعات مولکولی انتخاب، تعیین ترادف و توالی آن‌ها در بانک ژن ثبت گردیدند (PP916473-PP916479). تعیین ترادف محصولات PCR پس از حذف نوکلئوتیدهای اضافی نشان داد که ترادف های ژن پروتئین پوششی جدایه های ایرانی ToBRFV به طول 480 جفت باز می‌باشند. هفت جدایه ایرانی تشابه بالای ترادف نوکلئوتیدی و اسیدهای آمینه به ترتیب به میزان 6/99 تا 1/98 و 100 تا 6/95 درصد با یکدیگر داشتند. همچنین بر اساس نتایج بدست آمده در بین نمونه های مورد بررسی در این تحقیق و جدایه های موجود در بانک ژن، بیشترین درصد تشابه ترادف نوکلئوتیدی و اسیدهای آمینه به ترتیب به میزان 8/99 و 100 درصد مربوط به جدایه ایرانی Yaz.Mo.To1 و جدایه Zhangjiakou (از کشور چین) می‌باشد. با توجه به اهمیـت اقتصـادی گیاه گوجه فرنگی در ایران و به‌خصوص استان یزد، وجود ToBRFV منجر بـه کـاهش عملکـرد محصول می‌‌گردد. لذا تدوین برنامه‌های مدیریت بیماری‌های ویروسی در این استان باید مورد توجـه قـرار گیـرد. بررسـی‌‌های تکمیلی جهـت تعیین میزان پراکنش این ویروس در استان مذکور و شناسـایی ارقام متحمل و حساس نسبت به این ویروس در دست انجام می‌باشد. این بررسی اولین گزارش از وجود ToBRFV در گلخانه‌های گوجه‌فرنگی استان یزد می‌باشد.
کلیدواژه ها
Title
The first report of Tomato brown rugose fruit virus occurrence in tomato greenhouses of Yazd province
Authors
Reza Farajeyani, Hossein Massumi, Seyyed Alireza Esmaeilzadeh-Hosseini, Jahangir Heydarnejad, Akbar Hosseinipour Hosseinipour, Mohammad Maddahian
Abstract
Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) is an important pathogen of tomato plant belonging to Virgaviridae family, Tobamovirus genus. In order to detect ToBRFV in tomato greenhouses of Yazd province, during 2023, tomato plants with symptoms of mosaic, blistering, leaf deformation and ringspot and chlorotic local lesion on the fruit were sampled. Total RNA was extracted from the collected leaves and fruits using the Pars Tous Company kit, and used in reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Among the 88 samples of symptomatic tomato plants, in 43 cases the band of 800 bp related to the coat protein gene of ToBRFV was amplified and infection was detected. Based on the variety and region seven infected isolates were selected, sequenced and submitted in GenBank (PP916479-PP916473). Sequencing of the PCR products showed that the lengths of the coat protein genes of Iranian ToBRFV isolates are 480 bp. The similarity of nucleotide and amino acid homologies of seven Iranian isolates were found to be 98.1 to 99.6 and 95.6 to 100 percent respectively. Also, among the samples studied in this research and the isolates available in the GenBank, the Iranian isolate Yaz.Mo.To1. and Zhangjiakou isolate from China show the highest percentages of nucleotide and amino acid homology of 99.8% and 100%, respectively. Considering the economic importance of the tomato plant in Iran and especially in Yazd province, the existence of ToBRFV leads to a decrease in the yield of the product. Therefore, the development of viral disease management programs in this province should be considered. Additional surveys are being conducted to determine the distribution of this virus in the mentioned province and to identify tolerant and sensitive cultivars to this virus. This study is the first report of ToBRFV in tomato greenhouses of Yazd province.
Keywords
Reverse transcription-polymerase chain reaction, Coat protein, viral infection