شناسایی سه گونه تریکودرما از مزارع گندم استان ایلام
پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1368-25IPPC
نویسندگان
1گروه گیاهپزشکی- دانشکده کشاورزی- دانشگاه ایلام
2استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
چکیده
قارچ Trichoderma به عنوان عامل مهار زیستی توانمند علیه طیف وسیعی از بیماریهای گیاهی مطرح می باشد. این قارچ از هیفومیستهای خاکزی بوده که در اغلب خاکهای کشاورزی وجود دارد و به علت رشد سریع، قابلیت استفاده از بسترهای متنوع و مقاومت در برابر مواد شیمیایی مضر بسیار حائز اهمیت می باشد. جداسازی جدایههای قارچ تریکودرما از خاک به روش رقتسازی متوالی سوسپانسیون خاک انجام شد و از محیط کشت انتخابی Elad & Chet (1983) با اندکی تغییرات استفاده گردید. شناسایی ریختی گونههای تریکودرما براساس صفاتی از قبیل ویژگیهای پرگنه، اندازه، شکل و ویژگیهای کنیدی، اندازه، شکل و انشعابات کنیدیفورها با استفاده از کلید شناسایی Gams وBisset (2007) انجام شد. به منظور بررسی مولکولی جدایههای قارچی، ناحیه ژنی کدکننده فاکتور افزایش طول ترجمه (Tef) با استفاده از آغازگرهای EF1 و EF2 تکثیر و توالی یابی شدند. توالیهای بهدست آمده از تکثیر ژن با استفاده از نرمافزارv. 7.0.9.0 (Hall, 1999) Bioedit ویراستاری شدند. توالیها به پایگاه اطلاعات ژنوم NCBI معرفی و با کمک الگوریتم BLASTn برای شناسایی گونههایی با بالاترین درصد شناسایی، کمترین شاخص E و بالاترین درصد پوشش توالی به عنوان نزدیکترین توالی در نظر گرفته شدند. در این بررسی Outgrup مناسب انتخاب و بعد از همردیف کردن توالیهای بهدست آمده، درخت تبارزایی جدایهها با استفاده از الگوریتم درست نمایی بیشینه با 1000 بار بوت استرپ با استفاده از نرم افزار MEGA v11 رسم گردید. نتایج بررسیهای مولکولی، شناسایی ریختی جدایه های قارچی را تأیید کرد و جدایههای مورد بررسی شامل سه گونه T. longibrachiatum، T. harzianum و T. koningii بودند.
کلیدواژه ها
Title
Identification of three Trichoderma species from wheat fields in Ilam province
Authors
Maryam Heidarizadi, Khadijeh Abbasi
Abstract
The fungus, Trichoderma is considered as a powerful biocontrol agent against a wide range of plant diseases. This fungus is one of the soil hyphomycetes that exists in most agricultural soils and in order to rapid growth, the ability to use various substrates and resistance to chemicals is very important. Isolation of fungal isolates from soil was done by serial dilution method of soil suspension and the selective medium of Elad & Chet (1983) was used with some changes. Fungal isolates were identified based on morphological characteristics such as: mycelium features, size, shape and characteristics of conidia, size, shape and branching of conidiphores using the identification key of Gams and Bisset (2007). For molecular investigationsof fungal isolates, the gene region coding the translation elongation factor (Tef) was amplified and sequenced using EF1 and EF2 primers. Sequences obtained from gene amplification by Bioedit v. 7.0.9.0 software (Hall, 1999) were edited. The sequences were introduced to the NCBI and using BLASTn algorithm to identify the species with the highest identification percentage, the lowest E index and the highest percentage of sequence coverage were considered as the closest sequence. In this study, the suitable Outgrup was selected and after aligning the sequences, The phylogeny tree obtained using maximum likelihood algorithm with 1000 bootstraps using MEGA v 11 software validate the morphological data and the investigated isolates were including three species, T. longibrachiatum, T. harzianum and T. koningii.
Keywords
morphology, Phylogeny, Primer