اولین گزارش از ویروس رگبرگ روشنی انگور از گیاه Ampelopsis glandulosa
پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1629-25IPPC
نویسندگان
موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
چکیده
ویروس رگبرگ روشنی انگور (Grapevine vein clearing virus-GVCV) عضو جنس Badnavirus از خانواده Caulimoviridae می‌باشد. این ویروس موجب بروز علائم رگبرگ روشنی و بدشکلی در برگ‌های انگور گردیده و اولین بار در سال 2011 میلادی از آمریکا گزارش گردید. در بهار 1402 طی بازدید از یک نهالستان تجاری در استان گیلان علائم بدشکلی و رگبرگ روشنی در چند بوته انگور جواهر یا پورسیلین بری (Ampelopsis glandulosa) مشاهده گردید. نمونه‌های برگی تهیه شده از این گیاهان از نظر احتمال آلودگی به ویروس‌های Arabis mosaic virus، Grapevine fanleaf virus، Grapevine leaf roll associated virus-3، Grapevine fleck virus و Tomato ring spot virus با استفاده از روش الایزا و آنتی‌بادی اختصاصی (شرکت بیوربا، سوئیس) مورد آزمون قرار گرفتند. نتایج این آزمون‌ها منفی بوده و آلودگی به این ویروس‌ها در آنها ردیابی نگردید. با توجه به نوع علائم، احتمال آلودگی نمونه‌ها به ویروس GVCV با استفاده از روش PCR و بکارگیری دو جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده برای ناحیه ژن پلی‌پروتئین GVCV مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این آزمون نشان دهنده تکثیر یک قطعه دی.ان.ای بطول مورد انتظار حدود 461 جفت باز برای جفت آغازگر GVCV5098F-GVCV5558R و قطعه 246 جفت‌باز برای جفت آغازگر GVCV4142-GVCV4387 بود. توالی نوکلئوتیدی این قطعات به روش سنجر تعیین گردیده و با استفاده از ابزار BLAST با توالی‌های نوکلئوتیدی قابل دسترس در GenBank (پایگاه اطلاعات NCBI) مورد مقایسه قرار گرفت. توالی‌های بدست آمده دارای بیشترین درصد یکنواختی نوکلئوتیدی (6/97 تا 7/98 درصد) با توالی‌های گزارش شده از ویروس GVCV بود. این اولین گزارش از وقوع ویروس GVCV در کشور می‌باشد. گیاه Ampelopsis glandulosa از خانواده انگوریان (Vitiaceae) یک گیاه بالارونده یا بوته‌ای در فضای سبز شهری بوده که کشت آن در سالهای اخیر مورد توجه قرار گرفته است. ویروس GVCV از جمله ویروس‌های نوظهور بیمارگر در انگور بوده و قادر به انتقال توسط قلمه و شته‌ها می‌باشد. دامنه انتشار و احتمال حضور آن در تاکستان‌های کشور نیاز به مطالعات تکمیلی دارد.
کلیدواژه ها
Title
First report of Grapevine vein clearing virus on Ampelopsis glandulosa
Authors
Reza Pourrahim, Shirin Farzadfar
Abstract
Grapevine vein clearing virus (GVCV) is a member of the Badnavirus genus in the Caulimoviridae family. GVCV causes vein clearing and leaf deformation in the grapevines. It was first described in the USA in 2011. In the spring of 2023, Ampelopsis glandulosa plants exhibiting vein clearing and leaf deformation were observed in a commercial nursery in the Gilan province (North Iran). The symptomatic leaf samples were tested for Arabis mosaic virus, Grapevine fanleaf virus, Grapevine leaf roll associated virus-3, Grapevine fleck virus, and Tomato ring spot virus using ELISA assay with specific antibodies (Bioreba, Switzerland), but the results were negative for all the viruses tested. According to their symptoms, samples were tested for probable GVCV infection by PCR assay using two primer pairs designed specific to the polyprotein coding region of GVCV. Two DNA amplicons of the expected sizes 461 and 246 bp were produced using primer pairs of GVCV5098F-GVCV5558R and GVCV4142-GVCV4387, respectively. Nucleotide sequences of the obtained amplicons were determined using the Sanger method and compared with available sequences at GenBank using the BLAST tool in the NCBI database. Our sequences showed the highest nucleotide identity (97.6 to 98.7 %) to previously reported GVCV sequences. This is the first report of GVCV occurrence in Iran. Ampelopsis glandulosa, a member of the Vitiaceae family, is a climbing or shrub ornamental plant that has gained attention for cultivation in urban green spaces in recent years. GVCV is an emerging grapevine virus, transmitted by infected cuttings and aphids. Further studies are needed to understand the distribution of GVCV and the possibility of its presence in vineyards.
Keywords
Detection, Badnavirus, Emerging