اولین گزارش از آلودگی ویروس اف هستهدارها (Prunus virus F) در درختان آلبالو و گیلاس کشور
پذیرفته شده برای ارائه شفاهی
کد مقاله : 1672-25IPPC
نویسندگان
موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
چکیده
ویروس اف هستهدارها (Prunus virus F-PrVF) عضو جنس Fabavirus از خانواده Secoviridae میباشد. این ویروس اولین بار در سال 2017 میلادی از درختان گیلاس فاقد علائم خاصی در آمریکا شناسایی و گزارش شد. با توجه به اهمیت برنامه تولید نهال سالم و به منظور بررسی احتمال حضور ویروس PrVF در باغات هستهدار کشور، در طول سالهای 1401 تا 1403 طی بازدید از باغات و نهالستانهای تجاری در استانهای تهران، البرز و قزوین مجموعا 183 نمونه گیلاس (Prunus avium) و 117 نمونه آلبالو (Prunus cerasus) بطور تصادفی جمعآوری گردید. نمونهها از نظر احتمال آلودگی به ویروس PrVF با استفاده از روش RT-PCR و بکارگیری دو جفت آغازگر اختصاصی مورد آزمون قرار گرفتند. جفت آغازگر PVF1-CAF و PVF1-CAR و جفت آغازگر Fab-R2.1808F و Fab-R2.2546R برای تکثیر بترتیب ناحیهای از RNA1 و RNA2 ژنومی PrVF طراحی شده بودند. نتایج نشان دهنده تکثیر دو قطعه DNA بطول مورد انتظار 457 و 738 جفت باز بترتیب مربوط به RNA1 و RNA2 در 14 نمونه گیلاس و 25 نمونه آلبالو بود. توالی نوکلئوتیدی این قطعات در مورد 3 جدایه به روش سنجر تعیین گردیده و با استفاده از ابزار BLAST با توالیهای نوکلئوتیدی قابل دسترس در GenBank (پایگاه اطلاعات NCBI) مورد مقایسه قرار گرفت. توالیهای بدست آمده دارای بیشترین درصد یکنواختی نوکلئوتیدی (3/95 تا 4/98 درصد) با توالیهای گزارش شده از ویروس PrVF بود. این اولین گزارش از وقوع ویروس PrVF در کشور میباشد. رابطه مشخصی بین علائم و آلودگی نمونه به PrVF مشاهده نگردید که نشاندهنده احتمالا آلودگی نهان این ویروس در میزبانهای آلبالو و گیلاس میباشد. برخی مشاهدات از همراهی PrVF با عارضه زوال گیلاس در آمریکا ارائه شده است ولی هنوز اطلاعات دقیقی از خصوصیات بیماریزایی، نوع علائم و میزان خسارت این ویروس در هستهدارها در دسترس نیست. پراکنش، فراوانی و خصوصیات جدایههای ایرانی PrVF در باغات هستهدار کشور نیاز به مطالعات تکمیلی دارد.
کلیدواژه ها
Title
First report of Prunus virus F infecting sweet and sour cherry in Iran
Authors
Shirin Farzadfar, Reza Pourrahim
Abstract
Prunus virus F (PrVF) is a member of the Fabavirus genus in the Secoviridae family. PrVF was first identified and reported from sweet cherry trees in the USA in 2017. Considering the importance of the healthy seedling production programs and in order to investigate the possibility of PrVF presence in the stone fruit orchards, during a survey from 2022 to 2024, several commercial stone fruit orchards and nurseries were visited in Tehran, Alborz, and Qazvin provinces and a total of 183 and 117 leaf samples were randomly collected from sweet cherry (Prunus avium) and sour cherry (Prunus cerasus) trees, respectively. Samples were tested for probable PrVF infection by RT-PCR assay using two primer pairs specific to PrVF. Primer pair PVF1-CAF and PVF1-CAR and primer pair Fab-R2.1808F and Fab-R2.2546R were designed to amplify fragments of PrVF genomic RNA1 and RNA2, respectively. Two DNA amplicons of the expected sizes 457 and 738 bp corresponding to RNA1 and RNA2, respectively, were produced in 14 sweet cherry and 25 sour cherry samples. Nucleotide sequences of the obtained amplicons were determined in three isolates using the Sanger method and compared with available sequences at GenBank using the BLAST tool in the NCBI database. Our sequences showed the highest nucleotide identity (95.3 to 98.4 %) to the previously reported PrVF sequences. This is the first report of PrVF occurrence in Iran. There was no clear relationship between the symptoms and PrVF infection in the tested samples, which indicates the possible latent infection of PrVF in sweet and sour cherry hosts. Observations of the association of PrVF with sweet cherry decline have been reported in the United States, however, details of PrVF pathogenic characteristics, symptoms, and extent of damage in not yet available. Further studies are needed to understand the distribution, frequency, and properties of Iranian PrVF isolates in the stone fruit orchards of the country.
Keywords
Detection, Fabavirus, Emerging