مطالعه ریخت‌شناختی و مولکولی تعدادی از اعضای خانوادهTylenchidae Örley 1880 (Nematoda: Rhabditida) در استان آذربایجان‌غربی

پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1738-25IPPC (R1)
نویسندگان
1گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران.
2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران
3دانشگاه غیرانتفاعی آفاق، دانشکده کشاورزی، ارومیه، ایران
چکیده
استان آذربایجان غربی به دلیل برخورداری از زمین‌های حاصلخیز و مناطق طبیعی غنی، از جملة مهم‌ترین مناطق کشاورزی در ایران محسوب می‌گردد و زمینه فعالیت نماتدهای مختلف را دارا می‌باشد. نماتدهای خانواده Tylenchidae دارای تنوع بالایی هستند و پراکنش جهانی داشته و در بسیاری از محیط‌های زندگی مثل زمین‌های کشاورزی، چمن‌زارها و مراتع طبیعی یافت می‌شوند. این گروه از نماتدها اکثراً قارچ‌خوار یا جلبک‌خوار هستند و اهمیت اقتصادی زیادی ندارند ولی شناسایی آن‌ها به عنوان یکی از عوامل موجود در ریزوسفر ریشه گیاهان می‌تواند حائز اهمیت باشد. به منظور شناسایی ریخت‌شناختی و مولکولی نماتدهای خانواده Tylenchidae در استان آذربایجان غربی، طی سال‌های 1402 و 1403 تعداد 50 نمونه خاک از محیط ریزوسفر گیاهان مختلف جمع‌‌آوری شد. نمونه‌ها به آزمایشگاه تحقیقاتی نماتدشناسی دانشگاه ارومیه منتقل و نماتدها با استفاده از روش الک و سانتریفیوژ استخراج و در ادامه با استفاده از روش دگریسه به گلیسیرین انتقال داده شدند. پس از تهیه اسلایدهای میکروسکوپی از نماتدهای جدا شده، بررسی‌های ریخت‌شناسی و ریخت‌سنجی با استفاده از میکروسکوپ نوری مجهز به دوربین دیجیتال دینو انجام شد. در ادامه برای شناسایی مولکولی، ناحیه D2-D3 زیر واحد بزرگ ریبوزومی (D2-D3 28S rDNA) توالی‌یابی شد. توالی-های جدید بدست آمده با توالی‌های ثبت شده در بانک ژن مقایسه شدند. برای ترسیم درخت تبارزایی از روش Bayesian استفاده شد. در این تحقیق 14 گونه از 7 جنس شامل Basiria graminophila، Boleodorus thylactus، Coslenchus costatus، Discotylenchus discretus، Filenchus. andrassyi، F. aquilonius، F. cylindricaudus، F. pratensis، F. terrestris، F. vulgaris، F. sindhicus، F. thornei، Neopsilenchus magnidens، Psilenchus hilarulus شناسایی شدند. گونه‌های F. terrestris و F. sindhicus برای اولین بار از ایران گزارش می‌شوند. در گونه F. terrestris طول بدن 632-520 میکرومتر، طول استایلت 11-8 میکرومتر، طول دم 160-152 میکرومتر، فاکتور c 3/4-3/1 و فاکتور V 60-65 می‌باشد. این گونه دارای دو شیار جانبی است. همچنین در گونه F. sindhicus طول بدن 527-692 میکرومتر، طول استایلت 10-7 میکرومتر، طول دم 156-139 میکرومتر، فاکتور c 4/2-5/4 و فاکتور V 64-67 می‌باشد. این گونه دارای چهار شیار جانبی می باشد. در این تحقیق یک توالی از هر گونه بدست آمد که توالی‌های مربوط به گونه‌های Discotylenchus discretus، Filenchus. andrassyi، F. cylindricaudus، F. pratensis، F. terrestris، F. sindhicus برای اولین بار ارائه شدند که می‌توانند به غنی‌تر شدن بانک ژن کمک کنند.
کلیدواژه ها
 
Title
Morphological and molecular study of some species of the family Tylenchidae Örley 1880 (Nematoda: Rhabditida) in West Azerbaijan Province
Authors
Farzaneh Salamat ravandi, Mina Rastgou, Abas Mokarram hesar
Abstract
Due to its fertile lands and rich natural areas, West Azarbaijan province is considered as one of the most important agricultural regions in Iran and it has the field of activity of various nematodes. Nematodes of the family Tylenchidae have a high diversity and are globally distributed and can be found in many habitats such as agricultural lands, grasslands, and natural pastures. This group of nematodes are mostly fungivores or algaevores and do not have much economic importance, but their identification as one of the living factors present in the rhizosphere of plant roots can be important. In order to morphologically and molecular identification of nematodes of family Tylenchidae in West Azarbaijan province, 50 soil samples were collected from the rhizosphere of different plants during 2023 and 2024. The samples were transferred to the Nematology Research Laboratory of Urmia University and the nematodes were extracted using the sieve and centrifuge method and then transferred to glycerin using the De Grisse method. After preparing microscopic slides, morphological and morphometric studies were performed using an optical microscope equipped with a Dino digital camera. For molecular study, the D2-D3 region of the large ribosomal subunit (D2-D3 28S rDNA) was sequenced. The new sequences obtained were compared with the sequences submitted in the gene bank. Bayesian inference was used to create the phylogeny tree. In this research, 14 species from 7 genera identified which included; Basiria graminophila, Boleodorus thylactus, Coslenchus costatus, Discotylenchus discretus, Filenchus. Andrassyi, F. aquilonius, F. cylindricaudus, F. pratensis, F. terrestris, F. vulgaris, F. sindhicus, F. thornei, Neopsilenchus magnidens, Psilenchus hilarulus. F. terrestris and F. sindhicus are first report fromIran. In F. terrestris, body length is 520-632 μm, stylet length is 8-11 μm, tail length is 152-160 μm, c factor is 1.3-4.3 and V factor is 65-60. This species has two lateral lines. Also, in F. sindhicus, body length is 692-527 μm, stylet length is 7-10 μm, tail length is 139-156 μm, c factor is 4.2-5.4 and V factor is 64-67. This species has four lateral lines. In this research, one sequence of each species was obtained which the sequences related to the species of Discotylenchus discretus, Filenchus. andrassyi, F. cylindricaudus, F. pratensis, F. terrestris, F. sindhicus were introduced for the first time, which can help to enrich the gene bank.
Keywords
Nematode, Tylenchidae, morphology, morphometrics, Phylogeny