مطالعه مولکولی، ریخت سنجی و ریخت شناسی دو گونه از جنس Psilenchus de Man, 1921 (Nematoda: Psilenchidae) از استان لرستان

پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 1872-25IPPC (R1)
نویسندگان
1گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
2عضو هیات علمی
3دانشجوی دکتری دانشگاه لرستان
چکیده
نماتدهای جنس Psilenchus انگل ضعیف گیاهان و خزه‌ها هستند که از ریشه‌های مویین، سلول‌های اپیدرمی ریشه و ریزوئیدها تغذیه می‌کنند. از نظر تاکسونومی، گونه‌های این جنس در سال 1986 در خانواده مستقل Psilenchidae قرار گرفتند اما در سال 1987 این جنس به خانواده Tylenchidae منتقل شد. داشتن دو لوله جنسی و فاسمید از تفاوت‌های ریخت‌شناسی مهم این جنس و جنس‌های مرتبط آن با اعضای خانواده Tylenchidae است و مطالعات فیلوژنی اخیر با توالی‌های ریبوزمی نیز تخصیص خانواده مستقل برای این گروه را تایید می‌کنند. این جنس در حال حاضر دارای 21 گونه معتبر است که برای چهار گونه، توالی نوکلئوتیدی به ثبت رسیده است. به منظور بررسی گونه‌های جنس Psilenchus در شهرستان خرم‌آباد استان لرستان، تعداد 100 نمونه خاک از فراریشه درختان جمع‌آوری گردید. سپس استخراج نماتدها با روش سینی انجام و تثبیت نمونه‌ها با روش دگریس صورت گرفت. شناسایی نماتدها با استفاده از کلیدها و منابع معتبر صورت گرفت. مطالعات فیلوژن مولکولی با استفاده از توالی ناحیه ژنی D2-D3 28S rDNA انجام شد. با بررسی داده‌های ریخت‌شناختی، ریخت‌سنجی و استناد به منابع، دو گونه P. curcumerus و P. vinciguerrae شناسایی گردید. به منظور مطالعات مولکولی، به ترتیب یک و دو توالی نوکلئوتیدی از این ناحیه ژنومی برای گونه‌های مزبور به‌دست آمد. در مقایسه توالی گونه اول با توالی‌های موجود از این گونه در بانک ژن، فقط یک نوکلئوتید اختلاف وجود داشت. با توجه به وجود تنوع شکل دم در یک جمعیت (در برخی افراد دم نخی شکل با انتهای تیز یا گرد و در برخی انتهای دم گرزی شکل) از گونه P. vinciguerrae، دو توالی از هر دو شکل دم در جمعیت مورد مطالعه به‌دست آمد. در مقایسه دو توالی حاصل، تفاوتی ملاحظه نشد بنابراین تنوع شکل دم در این گونه تایید می‌گردد. از طرف دیگر مقایسه توالی‌های حاصل از این گونه با دو توالی به ثبت رسیده در بانک ژن از همین گونه، دو نوکلئوتید اختلاف را نشان داد.
کلیدواژه ها
 
Title
Molecular, morphometric and morphological study of two species of the genus Psilenchus de Man, 1921 (Nematoda: Psilenchidae) from Lorestan province
Authors
Arezoo Naghavi, Farahnaz Jahanshahi Afshar, Zahra Mirzaeipour, Eidi Bazgi
Abstract
Nematodes belonging to the genus Psilenchus are weak parasites of plants and mosses that feed on hairy roots, rhizoids and epidermal cells. Members of this genus were placed under the family Psilenchidae in 1986 and were subsequently transferred into the family Tylenchidae in 1987. Having two reproductive tracts and phasmids delimit this genus and its relatives from the traditional Tylenchidae and molecular phylogenetic studies using ribosomal markers apprive their placement inside the independent family Psilenchidae. So far, 21 species have been described under the genus Psilenchus and molecular sequences have been registered only for four species in the GenBank database. To study the diversity of species of the genus Psilenchus, a total number of 100 soil samples were collected from the rhizosphere of trees in Khorramabad county, Lorestan province. The nematodes were extracted using the Whitehead tray method and the samples were fixed using De Grisse method. Identification of nematodes was conducted using valid keys and literature. Molecular phylogenetic studies were performed using sequences of the D2-D3 expansion domains of 28S rDNA. Based on morphological and morphometric data, two species of the genus Psilenchus, namely P. curcumerus and P. vinciguerrae were identified. For molecular studies, one and two sequences were obtained for these species, respectively. In pairwise comparisons of the sequence of P. curcumerus with the sequences of this species previously available in the GenBank database, only one mismatch was observed. Based on the observed variation in tail shape of P. vinciguerrae (filiform to clavated tip), two sequences belonging to the specimens having the abovementioned tail tip shapes were compared, and no difference was observed between them. Comparison of the sequences of this species with two sequences of the same species in the GenBank, showed two mismatches.
Keywords
D2-D3 28S rDNA, Khorramabad, Psilenchinae, P. curcumerus, P. vinciguerrae