بررسی برهمکنش پروتئین – پروتئین معده میانیBemisia tabaci با انتقال ویروس پیچیدگی برگ پنبه (CLCuv)

پذیرفته شده برای ارائه شفاهی
کد مقاله : 1974-25IPPC
نویسندگان
1ندارم
2Varamin
3مدیریت جهاد کشاورزی شهرستان بابل، بابل، ایران
چکیده
سفیدبالک پنبه (Bemisia tabaci) یکی از چندین گونه سفیدبالک ها است که در حال حاضر یکی از آفات مهم کشاورزی محسوب می شود. این آفت با تغذیه از شیره گیاهی منجر به ایجاد لکه های رنگ پریده بر روی برگ ها و ضعیف شدن گیاهان می شود. همچنین به صورت غیرمستقیم هم خسارت زده و ناقل بسیاری از بیماری های ویروسی است. Begomovirusها یک گروه عمده از ویروس های گیاهی هستند که به طور انحصاری توسط B. tabaci به صورت غیر پایا از طریق همولنف منتقل می شوند. روده این حشره دارای برخی از گیرنده های پروتئینی مهم است که به ویروس اجازه ورود به همولنف حشره را می دهد. در این تحقیق برهمکنش بین دو پروتئین روده میانی B. tabaci که با CLCuV برهمکنش دارند شامل پروتئین شبه تیوردوکسین (شماره دسترسی: AQM74407) و زیر واحد I سیتوکروم اکسیداز (شماره دسترسی: AFQ62605) پیش بینی شد. پایگاه داده STRING 12.0 (http://string-db.org) برای پیش بینی برهمکنش پروتئین ها استفاده شد. شبکه ها با حداقل امتیاز برهمکنش مورد نیاز 150/0 ایجاد شدند و لیست های برهمکنش ها ایجاد شد. STRING یک پایگاه داده از تعاملات پروتئین شناخته شده و پیش بینی شده است. پایگاه داده شامل اطلاعات از منابع مختلف، از جمله منابع آزمایشگاهی، روش های پیش بینی محاسباتی و گروه های متنی عمومی است. بر اساس نتایج، سه مسیر غنی شده KEGG با تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین - پروتئین بدست آمد که شامل: فسفریلاسیون اکسیداتیو، چرخه سیترات (چرخه TCA) و مسیرهای متابولیک به دست آمد. علاوه بر این، عملکردهای مولکولی متفاوتی از جمله فعالیت دهیدروژناز NADH(ubiquinone)، فعالیت Ubiquinol-cytochrome-c ردوکتاز، فعالیت سیتوکروم-سی اکسیداز، اتصال به یوبیکینون، فعالیت انتقال الکترون و ... در این برهمکنش ها شناسایی شد. تغییر در این پروتئین ها می تواند هر کدام از این چرخه ها را مختل کرده و فرآیند انتقال ویروس را مختل کند. این مسأله می تواند به عنوان یکی از روش های کنترل سفیدبالک پنبه و ویروس CLCuv موردمطالعه و بررسی قرار گیرد.
کلیدواژه ها
 
Title
Protein-Protein Interaction Analysis of Bemisia tabaci midgut proteins interact with Cotton leaf curl virus (CLCuv) transmission
Authors
Vahid Reza Farmahiny Farahani, Samin Seddigh, Bahareh Hashemi
Abstract
The silverleaf whitefly (Bemisia tabaci) is one of several species of whitefly that are currently important agricultural pests. Its damage on plants includes removing plant sap, breakdown of the leaves of the plant, and leaf shedding. It is also a notorious vector for plant virus disease. Begomoviruses are a major group of plant viruses, transmitted exclusively by B. tabaci in a persistent circulative nonpropagative manner. This insect gut possesses some crucial protein receptors that allow specific entry of virus into the insect haemolymph. In this research, Interactions between two midgut proteins of B. tabaci which interact with CLCuV including thioredoxin-like protein (Accession no: AQM74407) and cytochrome oxidase subunit I (Accession no: AFQ62605) were predicted. STRING 12.0 database (http://string-db.org/) was used to predict the interacting proteins. The networks were created with a minimum required interaction score of 0.150 (low confidence), and the PPI lists were created. STRING is a database of known and predicted protein interactions. The database contains information from different sources, including experimental repositories, computational prediction methods and public text groups. According to the results, three KEGG enriched pathways were obtained by protein–protein interaction analysis which included: oxidative phosphorylation, citrate cycle (TCA cycle) and metabolic pathways. Additionally, various molecular functions were identified in these interactions, including NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity, ubiquinol-cytochrome-c reductase activity, cytochrome-c oxidase activity, ubiquinone binding, electron transfer activity, and others. Alterations in these proteins can disrupt any of these cycles and interfere with the virus transmission process. This issue can be studied and examined as one of the methods to control the cotton whitefly and CLCuV virus.
Keywords
Cotton leaf curl virus, Bemisia tabaci, Protein-protein interaction, STRING