باکتریهای همراه با گره ریشه توسکا ییلاقی در ایران
پذیرفته شده برای پوستر
کد مقاله : 2022-25IPPC
نویسندگان
1گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ولیعصر رفسنجان، رفسنجان
2گروه اکولوژی، محیط زیست و علوم گیاهی، دانشگاه استکهلم
3گروه گیاهپزشکی،دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری
4شرکت کشاورزی رضوی
چکیده
توسکا ییلاقی Alnus subcordata C.A. Mey)) به دلیل سرعت رشد بالا، توانایی تثبیت نیتروژن و تأثیر مثبت بر حاصلخیزی خاک، گونهای بسیار مفید برای جنگل کاری است. این درخت ممکن است جامعه میکروبی خاک را تغییر دهد و نقش حیاتی در چرخه مواد مغذی ایفا کند. در ایران، توسکا ییلاقی از مهم ترین گونه های تجاری جنگلهای شمال ایران است. در تابستان سال ۱۳۹۹، نمونهبرداری از گرههای تازهتشکیلشده روی ریشه درختان توسکای ییلاقی در جنگلهای هیرکانی (کاسپین) شمال ایران (شهرستان چالوس، غرب مازندران) انجام شد. ریشه و گرهها به طور کامل با آب شیر شسته شدند تا گلولای و ذرات خاک از بین بروند. گرههای جدا شده از ریشه به مدت ۲ دقیقه در سدیم هیپوکلریت 1 درصد ضدعفونی و چندین بار با آب مقطر سترون شسته شدند. سوسپانسیون حاصل از خردکردن قطعاتی از گره ریشه در آب مقطر سترون بهصورت مخطط روی پتریهای حاوی محیط YMA (عصاره مخمر، مانیتول، آگار) وSNA (نوترینت آگار، ساکاروز 1 درصد) کشت گردید و پتریها در دمای ۲۵ تا ۲۸ درجه سلسیوس نگهداری شدند. پس از ۳ تا ۵ روز پرگنههای باکتریایی روی پتریهای حاوی محیط کشت ظاهر شدند که پس از خالص سازی خصوصیات مولکولی 10 جدایه منتخب مورد بررسی قرار گرفت. DNA جدایهها استخراج و بخشی از ناحیه 16S rRNA با استفاده از آغازگرهای عمومی تکثیر و توالییابی گردید. مقایسه توالیهای بهدستآمده (شماره دسترسی ژن بانک: OR648117 OR648116, OR648114 PP901864, PP901865, PP916592, OR648092, PP892070, OR648175, OR648115) با توالیهای موجود در ژن بانک با استفاده از برنامه BLAST نشانگر شباهت ۹۸-۹۹ درصدی جدایهها به گونههای , Bradyrhizobium, Rhizobium Bacillus وAchromobacter بود. این اولین گزارش از جداسازی Bradyrhizobium Achromobacter, و Bacillus از گره ریشه توسکای ییلاقی در ایران است.
کلیدواژه ها
Title
Caucasian alder root nodule bacteria in Iran
Authors
Esmaeil Basavand, Pejman Khodaygan, Katharina Pawlowski, Heshmatollah Rahimian, Kamal Sadeghi
Abstract
Alnus subcordata, also known as the Caucasian alder, is a highly beneficial species for afforestation due to its rapid growth, nitrogen-fixing ability, and positive impact on soil fertility. This tree may change the soil microbial community and play a vital role in nutrient cycling. In Iran, Caucasian alder is one of the most valuable commercial species in the northern forests. In the summer of 2020, nodulated Caucasian alder roots were collected from the Hyrcanian (Caspian) forests in northern Iran (Chalus county, western Mazandaran) and brought, in paper bags, to the laboratory. The roots and their associated nodules were thoroughly washed with tap water to remove the mud and soil particles. The nodules were separated from the roots, surface disinfected with 1% (v/v) sodium hypochlorite for two min and washed several times using sterile distilled water (SDW). They were then placed in drops of SDW in a Petri dish and crushed finely using a sterile scalpel. Loopfuls of the resulting suspension, 20-30 min following crushing, were streaked onto plates of Yeast mannitol agar (YMA) and sucrose nutrient agar (SNA, 1% sucrose). Three to five days after incubation at 25-28°C, bacterial colonies appeared on plates. After purification of bacterial colonies, 10 isolates were selected and subjected to molecular tests. DNA was extracted from the isolates and a part of the 16S rRNA gene (approximately 1200 bp) was amplified and sequenced. Comparison of the nucleotide sequence with those present in GenBank indicated 98-99% identity of the isolates (GenBank accession numbers: OR648117, OR648116, OR648114, PP901864, PP901865, PP916592, OR648092, PP892070, OR648175, OR648115) with those of Bradyrhizobium, Rhizobium, Bacillus and Achromobacter, respectively. This is the first report on isolation of Bradyrhizobium, Bacillus, and Achromobacter from Alnus subcordata root nodules in Iran.
Keywords
Alnus subcordata, Root nodule, Rhizobia, Achromobacter, Bacillus